Главным достижением университета были не только новые научные и методические разработки. Новым стал сам подход к работе всех подразделений вуза. Курс на самостоятельное зарабатывание средств, провозглашенный в новой редакции устава УГНТУ, принятой в 1997 году, в котором практически полностью был обновлен раздел финансово-экономической деятельности, неуклонно претворялся в жизнь. За вузом было закреплено право на осуществление контрактного обучения, дополнительных образовательных, а также консультационных, информационных услуг, аудиторской, оценочной деятельности, маркетинга. Внебюджетные доходы позволяли вести капитальный ремонт, строительство, оказывать социальную поддержку работникам вуза. Деньги, заработанные сообща, старались тратить эффективно. Известный лозунг «Экономика должна быть экономной» был взят на вооружение и претворялся в жизнь неукоснительно. Проводилась планомерная работа по оптимизации общеуниверситетских расходов и экономии материальных ресурсов. На основании аудита разрабатывались мероприятия по экономии электроэнергии, воды, тепла.
С 2000–2001 учебного года использование кафедрами и деканатами средств, поступивших по контрактам и индивидуальным договорам, происходит по новому принципу — на основании бюджетов. Каждое структурное подразделение училось считать доходы и расходы: сколько нужно выделить на оплату труда, приобретение оборудования, командировочные расходы. Была проведена реорганизация финансовой службы университета и создано финансово-экономическое управление. Интенсивность финансовой жизни вуза выросла на несколько порядков. Если раньше существовала жесткая смета, которую было необходимо выполнять, то теперь многовидовая деятельность структурных подразделе ний вуза потребовала оперативных планов и смет. К 2003 году показатели по доходности и отдельным видам деятельности стабилизировались.
Особенно впечатляют масштабы реконструкции студгородка: в рекордно короткие сроки возводится спортивно-оздоровительный комплекс, после капитального ремонта здание Башгипронефтехим стало седьмым корпусом УГНТУ, вузу переданы Дворец имени С. Орджоникидзе и профилакторий завода «Уфанефтехим», в строй вошел учебно-жилой комплекс, общежития одно за другим преображаются, обретая современный облик. В декабре 1994 г. преподаватели и сотрудники университета получили ордера на квартиры в реконструированном 68-квартирном доме.
Ректор А. М. Шаммазов так охарактеризовал стратегию вуза: «Мы не ссылаемся на неблагоприятные условия, стремимся не выживать, а развиваться». И такой подход давал свои плоды. Уже к 1999 году вуз увеличил свою площадь на 15 тыс. кв. м. Интенсивный рост был необходим вузу: ведь количество студентов росло как на дрожжах, приближаясь к рекордной за всю историю вуза цифре — пятнадцати тысячам.
