Филиал УГНТУ в г. Октябрьском
Директор — Вячеслав Шарифуллович Мухаметшин.
Стимулом для развития Октябрьского филиала УГНТУ была туймазинская нефть. Для эксплуатации туймазинского месторождения нужны были инженерные кадры, которые и стал готовить филиал. Сегодня в ОФ УГНТУ работают две выпускающие кафедры. Прием студентов осуществляется по специальностям «Машины и оборудование нефтяных и газовых промыслов», «Разработка и эксплуатация нефтегазовых месторождений», «Бурение нефтяных и газовых скважин» и направлению «Нефтегазовое дело» (бакалавриат). Преподаватели филиала ведут постоянную работу по совершенствованию форм и методов обучения. Прекрасная материальная база позволяет осуществлять учебный процесс, учитывая самые современные требования. В филиале проводится также научная и конструкторская работа по совершенствованию техники и технологии бурения глубоких скважин и добычи нефти и газа; по проектированию инженерных сетей и систем; по проектированию нестандартного оборудования; по охране окружающей среды.

Филиал УГНТУ в г. Салавате
Директор — Фанис Мирзагитович Хазиев.
Филиал в г. Салавате был открыт в 1956 г. В городе большой нефтехимии филиал ориентирован на выпуск специалистов, без которых на производстве не обойтись. «Машины и аппараты химических производств», «Химическая технология природных энергоносителей и углеродных материалов», «Электрооборудование и электрохозяйства предприятий, организаций и учреждений» — вот набор специальностей, которым обучают в филиале. Занятия проводятся в обновленных аудиториях и лабораториях. Салаватский филиал один из первых в университете ввел рейтинговую систему оценки знаний. Система учета знаний студентов СФ УГНТУ «Рейтинг» была зарегистрирована в отраслевом фонде алгоритмов и программ еще в 2002 году. Большое внимание уделяется подготовке преподавательских кадров. Перспективная молодежь учится в аспирантуре, защищает диссертации. Действующий в филиале факультет повышения квалификации руководящих работников и специалистов помогает поддерживать устойчивую обратную связь с промышленными предприятиями, отслеживать качество знаний и карьерный рост выпускников.

Филиал УГНТУ в г. Стерлитамаке
Директор — Игорь Хуснутович Бикбулатов.
Стерлитамакский филиал УГНТУ решает задачу подготовки специалистов для предприятий города и южных районов Республики Башкортостан. Стерлитамакский филиал ведет обучение по следующим специальностям: «Машины и аппараты химических производств», «Автоматизация химико-технологических процессов в нефтепереработке и нефтехимии»,  «Химическая технология органических веществ», «Охрана окружающей среды и рациональное использование природных ресурсов». Оснащенность материальной базы филиала  не уступает многим самостоятельным вузам. Студенческий городок филиала расположен в новом центре Стерлитамака. Здесь созданы все условия для полноценной учебы, занятий спортом и отдыха. Филиал располагает оборудованными учебными и научными лабораториями. Студенты могут пользоваться Интернетом, работать в библиотеке с обширным книжным фондом. Для старшекурсников есть зал курсового и дипломного проектирования. В последние годы количество абитуриентов, избравших для поступления СтФ УГНТУ, растет.

Учебно-научно-производственный центр «ФИНЭК »
УНПЦ «ФИНЭК» открыт для тех, кто хочет повысить свой профессиональный уровень. Здесь можно пройти курс подготовки по наиболее востребованным программам: бухгалтерский учет, информатика; информационные системы в экономике, кадровой службе, торговле; менеджмент, управление персоналом; современная архитектура, дизайн; компьютерная графика; иностранные языки (английский, немецкий, французский). Занятия проводят высококвалифицированные педагоги с большим опытом работы. По окончании обучения выдаются документы государственного образца: свидетельство о повышении квалификации или диплом о профессиональной переподготовке. Еще в 2000 году была получена аккредитация Института профессиональных бухгалтеров. «ФИНЭК» имеет благодарственное письмо, где отмечается высокий профессионализм в работе и большой вклад в деятельность службы занятости.